Prema ovom ugovoru, Sveta Stolica će u BiH osnovati Vojni ordinarijat za dušobrižništvo katoličkih vjernika pripadnika Oružanih snaga BiH, a vojnog ordinarija će imenovati Vrhovni Svećenik, o čemu će prethodno obavijestiti Vijeće ministara BiH.
Na današnjoj, petoj sjednici Mješovite komisije, zaključeno je da će Vijeću ministara BiH biti upućena informacija o provođenju Osnovnog ugovora između BiH i Svete Stolice i Dodatnog protokola na Osnovni ugovor.
Osim ministra Halilovića i apostolskog nuncija D'Errica, članovi Mješovite komisije su i ministar vanjskih poslova BiH Sven Alkalaj, ministar civilnih poslova BiH Sredoje Nović, ministar pravde BiH Bariša Čolak, zamjenik ministra finansija i trezora Fuad Kasumović, mons. Pero Sudar, tajnik Apostolske nuncijature Waldemar Stanislaw Sommertag, don Tomo Vukšić i fra Ivan Sesar.
Mandat ove komisije je do septembra 2010. godine.